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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一支用于石油化工物料而被遵守的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“产生废弃物”当上“藏宝小原子”的心酸历史进程相似性,知道近三十年才被得知其核心的生物制品学实用功能,从此以后“坐起农奴把声乐”,十分是在免疫性细菌感染性疫情科学研究域内推陈出新。另一个数篇开题报告有关资料了在几种细菌感染性疫情的生物对模型中接受衣康酸或其化学式修饰语繁衍物制品的中药治疗益处,并得知其潜在性靶点。管于衣康酸的“前生”与“此生”,具体情况见软文《乳酸的逆转兄弟姐妹——衣康酸!本文让你陪我认知衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用修饰语蛋白酶组学产品,实现1000+什么难以理解的度突显位点验出,维持复现著名靶点,全周边所有地方生信研究分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“挖掘”到“核实”全工作流程服务性,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、进行实验注意事项

02、实际数据表格

03、经“点”再次出现

在实际动态数据中,检测出个参考文献中宣传报道的經典靶点极其衣康酸表达位点,如1个被挖掘的衣康酸共价表达淀粉酶KEAP1,都有糖酵解通道中的3个核心所在酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,并且 炎性小体组成了淀粉酶NLRP3和肿瘤细胞烂掉整个过程中的核心所在淀粉酶RIPK3等,其质谱图以下几点图图示。

04、物料性能

1.多方面质控

房地产业化特异形探头孵育、SDS-PAGE监测、WB认证、样板有关的性浅析等各个位监测,狠抓活动的结果耐用性。

2.高稳定性质谱器材品台

在Orbitrap Astral全新新一代的高辩认质谱仪提升下,实现了衣康碱化掩盖位点及蛋白质鉴定结论新的深度,保驾护航科学有效的研究发现。

3.全程序一走式保障

应用场景拜谱生物体成熟的实验报告app,可作为“血细胞培养计划→检侧器孵育→WB检侧→深奥度衣康硝化作用体现检侧→专用生信介绍→指定位点PRM校验”全步骤工作,省时省劲更省时。

05、解析信息内容(位置)

06、拜谱生物路径

PART 2、论文参考文献推荐

论文参考文献一

英文翻译主题词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

2英文子标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

调查文章:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

医学文献二

英文版标题格式:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文翻译名称:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

的研究內容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、实例并衍生基本思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13拥有弱于的底物运用效果,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康酸性反应绘制组评测参数中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用掩盖(如下所述图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结ppt

为TCA配置中的中部消化吸收物,衣康酸调高消化吸收、抗体检测抗体和细菌感染互不之间的互不用,为中药诊治抗体检测抗体细菌感染性常见症状展示了替换中药诊治措施。衣康酸的结构特征中的亲电性α,β-不饱满羧酸的结构特征能对膳食纤维质上的活力性半胱氨酸残基完成烷基化装饰(迈克尔加强体现),这一项译文资料后装饰被被称作“衣康酸装饰(itaconation)”,因而导致膳食纤维质功效,监测抗体检测抗体回应和消化吸收途经,为各种各样常见症状用药产品研发展示新难点。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸突显蛋白质组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床医学绝对的降钙素原检测靶向药物消化吸收组(QMT1000)或体力分泌率靶向疗法分泌率组企业产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

符合文献资料

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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