
2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱动物为其提供m6A甲基化分享技巧服務,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。
句子标题:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)
企业机构:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院
探析村料:小鼠脑组织
拜谱带来了技术水平:m6A甲基化(MeRIP-seq)
文献综述图:
图1| 英文论文图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)
学习没想到
1.DCI小鼠海马中m6Adna突显的提升
探讨工人一方面搭建了高脂饮食搭配和的了解问题(DCI)的小鼠模板。为是比较比组(n = 3)和DCI组(n = 3)彼此的m6A什么是表观遗传遮盖,探讨工人安全使用MeRIP-seq完成了转录组时间范围内的m6A-seq剖析。在DCI组的10664个识别码什么是表观遗传转录物(mRNAs)国共知道比组的23719个不重合的m6A峰。相比较下面,DCI组表达出23,759个非重合m6A峰。当中,9346个甲基化什么是表观遗传在比组和DCI组彼此重合(图2)。
图2| 剖析组和DCl组m6a遮盖遗传基因的维恩图
图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的转换
图4| 一定的差异甲基化m6A位点的径路聚集
2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据文件的协力深入分析
接下来学习人群将m6A MeRIP-Seq的统计资料和原本RNA-Seq的统计资料实现协同探讨,知道163个mRNA,m6A峰和mRNA品质有效提升。41种mRNA的m6A和mRNA品质上浮,14种mRNA品质下跌。显然,30个什么是dnamRNA表示上浮,m6A品质下跌,77个什么是dnamRNA表示下跌,m6A品质上浮(图5A)。另外,打造了个PPIwifi网络来屏幕上显示163个什么是dna识别码的淀粉酶彼此的连到(图5B)。
图5| m6A甲基化与mRNA表现的结合定量分析
图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG探讨
拜谱海洋生物个人心得体会
本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生物制品提供了m6A甲基化系统产品,拜谱怪物可提供完善成熟的蛋白酶组学、消化吸收组学、转录组学以其几组学协同产品的技術服务的,欢迎致电咨询!
参照资料:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.