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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网络上药学学具体分析草酸钙肾结石腐蚀应激反应和支原体感染拉伤制度

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿设备常用见的慢性病最为。肾组识中CaOx结晶过过饱和火成岩会诱发肾小管上皮细胞挫伤和凋亡,因此诱发肾结石的构成。短链肌肉酸由直肠内厌氧反应器病菌沤肥饮食营养仟维引起,实际上在部分直肠深层中更好地发挥出来功能,所以在设备总体水平上也更好地发挥出来关键因素功能。当中,丁酸是最丰富的的短链肌肉酸,含有免疫系统可抑制和免疫系统可抑制功能,本探析论述丁酸对CaOx肾结石的功能下列不属于内在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院门诊泌尿内科吴忠专家、周子健教授于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教援、周子健院士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物体与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了系统药学学提供服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

好的文章公司名称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 买家企事业单位:华山诊所 的研究文本:大鼠、HK-2细胞系 分类问题:对应组(Con)、沙盘模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱保证枝术:微信网络药剂学学监测

策略过程图

科研毕竟

探讨方案人先建设方案大鼠模板,凭借生理问题生化学统计指标和组织机构病理报告学脱色等探讨方案行为会发现丁酸就能够变少CaOx模板大鼠肾CaOx尖晶石的导致和挫裂伤,持续改善CaOx模板大鼠的宫颈炎症挫裂伤和钝化产品的过多形容。另外,丁酸还可可以抑制草酸引发的HK-2肿瘤细胞膜挫裂伤、钝化应激性和肿瘤细胞膜凋亡。 为研究研究性丁酸框架和靶遗传什么是什么是人类什么是遗传dna网格,研究研究想关人员从PubChem查看丁酸和丁酸酯的二维和三维图框架(图1A)。经由PharmMapper信息库和Uniprot信息库治理 后共需求出113个丁酸靶遗传什么是什么是人类什么是遗传dna供更深层次的一个脚印研究。将遗传什么是什么是人类什么是遗传dna详尽信息导到STRING信息库,通过PPI网格研究。Cytoscape拿出了顺序排列的前20的交通联络线靶遗传什么是什么是人类什么是遗传dna的详尽网格图,包涵CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。以下交通联络线遗传什么是什么是人类什么是遗传dna与网格中的任何遗传什么是什么是人类什么是遗传dna均表面出一些的想关性,就说明以下遗传什么是什么是人类什么是遗传dna应该挥发着协同作战效应。GO和KEGG研究阐述了丁酸交通联络线遗传什么是什么是人类什么是遗传dna的想关经由和生态学工程学功能表(图1C)。交通联络线遗传什么是什么是人类什么是遗传dna包括与类固醇刺生长激素回话、阳极防氧化应激化学反应性回话、化学式活化氧组织对类固醇刺生长激素促使的不起影响及对偏酸化学式杂质的不起影响管于。总而言之上述,以下交通联络线遗传什么是什么是人类什么是遗传dna包括参与性了阳极防氧化应激化学反应性和对化学式活化氧的生态学工程不起影响方式,是肾结石建立机制化中至关比较必要的经由,这是因为丁酸应该在肾结石中挥发比较必要效应。

图1| 丁酸的结构与靶DNA线上讲解(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进每一步宇宙探索丁酸对CaOx肾结石真的切靶表观遗传,论述阐述考生合理利用GEO数据分析报告库对GSE73680中安全對照与CaOx肾结石人群的表观遗传对比阐述来了论述阐述。對照组与CaOx结石人群的为偏态性对比阐述展现爱表观遗传(DEGs)选择标准规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个表观遗传发生的为偏态變化,这当中3379个(89.4%)表观遗传展现爱调涨,404个(10.6%)表观遗传展现爱再降(图2A)。对DEGs来聚类分析阐述法阐述,热图界面显示了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类分析阐述法表现(图2B)。然后,论述阐述考生可以通过GeneCards数据分析报告库人工工资鉴定会了370个将与CaOx肾结石有关的内容的的表观遗传,排明前20位的预侧表观遗传试述有关的内容的性评价右图2C如图。为了能寻得丁酸中药治疗CaOx肾结石的关健靶点,论述阐述考生将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关的内容的表观遗传正确处理拥有打了个个Venn图。结果英文,CYP2C9被判别为丁酸关系CaOx肾结石的隐藏靶点(图2D)。不仅而且,论述阐述考生还来了丁酸与CYP2C9的原子核嫁接,CYP2C9的4个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸共同用途,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在应用微信网络药理学学推测CYP2C9是丁酸决定CaOx肾结石的靶什么是基因后,科研工人还经过细胞系系实验所证明了CYP2C9可缩减草酸诱惑的HK-2细胞系系的ROS平行、炎症病变受伤和凋亡。

图2| 大多据库综合深入分析估计CYP2C9是丁酸反应于CaOx肾结石的靶什么是基因

理论研究毕竟

本探索第一个发掘丁酸在里面和里面均能抑止CaOx肾结石3d模型的防腐蚀应激状态性和发炎挤压伤,继而依据电脑在线药学学筛分实现丁酸印象CaOx肾结石的潜在性靶点——CYP2C9,最后的依据生殖細胞实验性印证CYP2C9在草酸盐促进的HK-2生殖細胞ROS质量、发炎挤压伤和凋亡。这样的发掘显示丁酸或者依据抑止CYP2C9来抑止CaOx肾结石的防腐蚀应激状态性,降低发炎挤压伤。这一项工作中拜谱生态学体给予了电脑在线药学学工艺服务培训于,与此同时拜谱生态学体可上升非常成熟成熟的的基因遗传组学、核核苷酸组学、产生组学等多个学新产品及工艺服务培训于,欢迎辞拨打询问! 参考资料文献综述:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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