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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于免疫抗体鱼类特女性朋友、寡核苷酸突显成本费慷慨激昂或进行操作步骤比较复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯博士生导师团队图片在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个成本低的投入、跨植物物种、全网络平台兼容的全新解决方案。

期刊论文概述

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我们小学科学技术课院隐性基因与成长发育动物技术体学深入分析所和我们隐性基因法学会主办者的国家学术讨论探索杂志,全力于新闻稿一生小学科学技术课和中医学隐性基因学教育方向的创新性深入分析优秀成果。JGG 202历经四年度干扰细胞因子7.1,Scopus学术讨论探索杂志评述指标体系CiteScore 9.9,位于JCR 202历经四年度GENETICS & HEREDITY教育方向Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY教育方向Q1区,位于我们小学科学技术课院杂志系统分区动物技术体学商品类别1区(Top杂志),隐性基因学和血生化与原子核动物技术体学小类双1区。

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什么东西是HEATag

有效的“二合为一体”设置

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组合而成的协同血清

「定位手机器」电源模块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化掩盖(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「无线联接器」引擎 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)指数条状码来进行共价接连。

“1+1>2”的成果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样板标记图片与可追溯。

Fig1: HEATag几斤标注机理构造图

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操作验测

HEATag才是有大多能打?

会在的不同要求下,满足哺乳期宠物体生殖细胞系单体生殖细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。探讨人员为 HEATag 设备了多轮 “心理压力测式”,从上皮血细胞系到上皮血细胞,从常溫到低温制冷的效果,从新鲜范本到确定范本,全方面核实它的稳固性和牢靠性。

一、轮考试重要性辅乳期昆虫上皮上皮细胞膜系:探析的人员考虑了出自于人、鼠、仓鼠以下三个种类的四类上皮上皮细胞膜(HEK293T、K562、MEF、CHO),在高温下要 HEATag 标注后融合测序。结果英文回收利用的 11447 个上皮上皮细胞膜中,85.66% 都能能够 HEATag 方形码准确性匹配好到原种类,样表间交错水污染非常少,UMAP 聚类算法剖析也是一直证明材料,HEATag 方形码与种类炎症因子朋友dna组特点超高一致性。 然后接着,测式情况进两步持续:深入分析的人员试 在 4℃下符号新颖感受损人体神经細胞系、在制冷下符号甲醇固定的好受损人体神经細胞系,因此随便符号受损人体神经細胞系核。最后显示照样精彩:因此情况下,样例那些固化的标签与种类数据均含有良好的想关性,转换精确度率超 95%。倘若甲醇固定的好会造成中度的转录本交差被污染的,受损人体神经細胞系核提纯会起少量的 RNA 溜走,受损人体神经細胞系品类的批注最后显示照样与新颖感样例要保持同样,证实 HEATag 能够 符号区别整理情况下的實驗样例。

Fig2: HEATag 可在有差异生活条件下达到单内部转录组混样分享

能标注乳期绿色和海洋资源无脊椎神经绿色的原代组织

比如说細胞核系检测是 “基本题”,那组织开展模本就算 “叠加题”, 这一些模本一般情况下因細胞核性质繁多、大环境应用性个性化,称为标注水平的 “突破点”,而 HEATag 恰巧在这一些 “突破点” 上展现什么了优势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸机构,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不单能被最准判断,几乎所有其主要上皮细胞型号的聚类分析最后都比较清楚可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋资源生态学的自适应性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 条型码与植物物种转录组包括较高一样的性,不能冒出因高盐学习环境诱发的 “记号没有效果”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可体现哺乳期哺乳动物组织开展范例几斤 scRNA-seq 阐述

Fig4: HEATag可进行优质海域无脊柱动物界诸多 scRNA-seq 分享

HEATag与细胞膜的结合起来会激发转录组的明显变

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在完整标记图片目标的与此同时,是不会对事件的转录混合物析造不干扰,绝对了研发信息的逼真性。

Fig5: HEATag并不会引响样本量的 RNA 把你想表达出来状态

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未来的发展可期

HEATag 能为单内部设计受到一些 ?

HEATag 的价格,远不是只有于 “解决方法标签的问题”,它的灵化学活化高性和普遍性,在为单人体细胞科学研究加载比较多更多可能性性

从应运场景中来瞧

HEATag 能覆盖率从 “简易十分介绍”(如癌结构与普通结构、用量外理与比对)到 “新一波化实验”(如结构受损細胞图谱绘图、高通骁龙量选择)的全区间市场需求。随着时间推移 PIP-seq、Stereo-cell 等新式可扩充技巧的进展,HEATag 还能拓宽渠道骤加强单受损細胞实验的通量,推动科技团体发展更新一波化的大型项目。

从跨教育领域空间来谈

HEATag 不仅能使用做转录组学,还能与表观什么是基因组学、胆固醇质组学、空間组学等技巧结合,顺利通过个性定制字段和寡核苷酸队列,HEATag 也应该枯燥结合不同于的组学具体流程,不印象数据信号阻止程度。一同,通过HEATag还也应该未来发展单细胞膜糖组学论述技巧。

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合伙动态图片

拜谱生态学与陈凯博士生导师实现最初合作方式意愿

值不值得了解的是,在 HEATag 技術展示出出较大适用发展空间的原型下,拜谱菌物学已与华南地区海底资源科学学与项目浙江实验设计性室(西安)陈凯教受完成阶段联合意向书。当事人运作规划重点围绕 HEATag 技術的产业的发展化离地、科技研究分析app等方向盘展开图深度的协同运作,驱动这个低的成本、跨种类的单神经受损细胞核标上技術速度快适用于其实科技研究分析动画场景,为更大实验设计性室提高提高效率、经济社会的单神经受损细胞核研究分析方式,推动科技研究分析运我们在神经受损细胞核菌物学学、海底资源菌物学学、慢性病机能等域得到更大冲刺
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